Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms