Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms