Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zc3h18Q0P678 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms