Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms