Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnnm1Q0GA42 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms