Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
MestQ07646 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
MestQ07646 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
MestQ07646 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms