Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms