Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gdf3Q07104 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gdf3Q07104 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gdf3Q07104 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gdf3Q07104 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gdf3Q07104 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gdf3Q07104 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gdf3Q07104 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gdf3Q07104 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gdf3Q07104 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gdf3Q07104 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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