Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnb1Q03717 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms