Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scg2Q03517 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scg2Q03517 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms