Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb5Q02739 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gjb5Q02739 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb5Q02739 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb5Q02739 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb5Q02739 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb5Q02739 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb5Q02739 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb5Q02739 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms