Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VcpQ01853 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms