Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms