Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms