Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb2Q00977 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms