Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SeleQ00690 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SeleQ00690 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms