Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms