Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp9bP98195 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms