Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms