Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig3P97386 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lig3P97386 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms