Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Otx2P80206 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Otx2P80206 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms