Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad50P70388 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad50P70388 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rad50P70388 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms