Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1P70338 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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