Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux2P70298 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux2P70298 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux2P70298 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms