Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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