Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rps3P62908 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rps3P62908 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms