Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rps11P62281 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms