Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps5P59438 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hps5P59438 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms