Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl3P58873 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms