Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P58686 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P58686 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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P58686 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P58686 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P58686 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P58686 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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P58686 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P58686 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P58686 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms