Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd4P58467 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd4P58467 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms