Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms