Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn18P56857 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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