Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pdcd5P56812 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pdcd5P56812 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms