Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmoP56726 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmoP56726 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SmoP56726 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms