Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf5P56477 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms