Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defb1P56386 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms