Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp1P56183 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp1P56183 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms