Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacnb3P54285 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms