Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ClgnP52194 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ClgnP52194 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms