Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TspoP50637 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TspoP50637 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TspoP50637 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TspoP50637 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TspoP50637 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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