Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnni3P48787 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms