Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nedd4P46935 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms