Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx1-2P42580 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx1-2P42580 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms