Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf9P41274 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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