Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms