Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf1P39428 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms