Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Grin1P35438 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms