Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TbpP29037 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TbpP29037 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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