Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Defa3P28310 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms